Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms