Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms