Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms