Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms