Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms