Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pole3Q9JKP7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pole3Q9JKP7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pole3Q9JKP7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pole3Q9JKP7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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