Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl39Q9JKF7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms