Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp5Q9JKD3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms