Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms