Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms