Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms