Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms