Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms