Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp12Q9D9M2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp12Q9D9M2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp12Q9D9M2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Usp12Q9D9M2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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