Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx5Q9D8U8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms