Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms