Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms