Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Borcs6Q9D6W8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Borcs6Q9D6W8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms