Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Rab11fip1Q9D620 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip1Q9D620 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip1Q9D620 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Rab11fip1Q9D620 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rab11fip1Q9D620 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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