Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms