Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3404Q9D506 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3404Q9D506 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3404Q9D506 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3404Q9D506 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3404Q9D506 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3404Q9D506 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3404Q9D506 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3404Q9D506 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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