Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3D0

Ttpal, Alpha-tocopherol transfer protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpalQ9D3D0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtpalQ9D3D0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms