Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms