Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms