Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx17Q9D0I4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms