Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snw1Q9CSN1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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