Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms