Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms