Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rab5aQ9CQD1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab5aQ9CQD1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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