Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms