Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ncbp2Q9CQ49 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ncbp2Q9CQ49 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ncbp2Q9CQ49 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ncbp2Q9CQ49 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ncbp2Q9CQ49 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms