Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms