Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms