Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim3Q99PE5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smim3Q99PE5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smim3Q99PE5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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