Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mrpl3Q99N95 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl3Q99N95 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms