Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tdrd1Q99MV1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tdrd1Q99MV1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tdrd1Q99MV1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tdrd1Q99MV1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tdrd1Q99MV1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tdrd1Q99MV1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tdrd1Q99MV1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms