Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms