Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PtprtQ99M80 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PtprtQ99M80 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PtprtQ99M80 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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PtprtQ99M80 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PtprtQ99M80 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PtprtQ99M80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PtprtQ99M80 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PtprtQ99M80 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms