Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms