Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms