Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms