Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms