Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smim11aQ99J19 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Smim11aQ99J19 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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