Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb6Q922F4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms