Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms