Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms