Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1bQ91YK2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms