Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klc3Q91W40 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms