Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BbxQ8VBW5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms