Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms